注意，PDF加密功能或有資安疑慮！

對於該如何保護PDF檔案，ISO(國際標準組織)有一套詳盡的定義，使得所有使用者都能便利地加密PDF文件，而不必尋求第三方軟體的幫助。近來，一個來自於德國的研究團隊研發出了可以從加密PDF文件中取出數據的手段，引起資安界的注意。